Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab3ipQ68EF0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms