Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q66JV7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms