Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2bQ64511 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Top2bQ64511 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms