Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprdQ64487 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprdQ64487 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms