Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Irf4Q64287 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms