Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc18Q640L5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc18Q640L5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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