Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PatjQ63ZW7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PatjQ63ZW7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms