Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sp4Q62445 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sp4Q62445 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Sp4Q62445 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sp4Q62445 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Sp4Q62445 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Sp4Q62445 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms