Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trim28Q62318 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms