Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp1Q62209 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp1Q62209 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms