Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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