Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm38Q62176 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rbm38Q62176 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbm38Q62176 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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