Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Prkd1Q62101 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prkd1Q62101 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Prkd1Q62101 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prkd1Q62101 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd1Q62101 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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