Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Phox2aQ62066 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phox2aQ62066 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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