Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Npm1Q61937 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npm1Q61937 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms