Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg2Q61878 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms