Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifi47Q61635 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms