Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gli3Q61602 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms