Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne1Q61457 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccne1Q61457 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms