Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsx2Q61412 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms