Protein–RNA interactions for Protein: Q61382

Traf4, TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4Q61382 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Traf4Q61382 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Traf4Q61382 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf4Q61382 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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