Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc6Q61143 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc6Q61143 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms