Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fzd4Q61088 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fzd4Q61088 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms