Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NinQ61043 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NinQ61043 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NinQ61043 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NinQ61043 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NinQ61043 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NinQ61043 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NinQ61043 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NinQ61043 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NinQ61043 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NinQ61043 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NinQ61043 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms