Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Grik1Q60934 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Grik1Q60934 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms