Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ripk1Q60855 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms