Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf8Q60846 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf8Q60846 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms