Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RelnQ60841 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelnQ60841 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelnQ60841 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RelnQ60841 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RelnQ60841 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RelnQ60841 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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