Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Traf3Q60803 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms