Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms