Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mkrn3Q60764 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mkrn3Q60764 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms