Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha1Q60750 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms