Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PmelQ60696 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmelQ60696 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmelQ60696 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmelQ60696 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmelQ60696 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms