Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2f1Q60632 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms