Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xrcc1Q60596 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xrcc1Q60596 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms