Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms