Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema5bQ60519 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms