Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc5a6Q5U4D8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms