Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf1Q5U4C3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf1Q5U4C3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms