Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms