Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trim38Q5SZ99 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Trim38Q5SZ99 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Trim38Q5SZ99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim38Q5SZ99 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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