Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd40Q5SUE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms