Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme4Q5SSW2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms