Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d1Q5SSN7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms