Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TefmQ5SSK3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TefmQ5SSK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms