Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r223Q5SSA0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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