Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms