Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88aQ5SNZ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms