Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Odf3bQ5M8M2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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