Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SynaQ5G5D5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SynaQ5G5D5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms